<MTEntries lastn="6" sort_by="modified_on" blog_ids="1,2,3" sort_order="descend">
sort_byとlastnを同時に使うと、sort_byの効力がなくなりますよ！
という注意でした。（自分向けですが）
かわりに
limit="6"を使えばOKでしょう。
たとえ sort_by モディファイアでタイトル順、かつ、sort_order モディファイアで ascend (昇順) を指定しても、出力する結果は、最新 5 件のブログ記事です。これは、recently_commented_on モディファイアを同時に設定しているときも同じです。これらは lastn モディファイアと同時に使用しても効果はありません。